BIOINFORMATIQUE - 3E ÉD.
COURS ET APPLICATIONS
La bio-informatique a pour but d'intégrer des données d'origines très diverses pour modéliser les systèmes vivants afin de comprendre et prédire leurs comportements (analyse du génome, modélisation de l'évolution d'une population animale, modélisation moléculaire, reconstruction d'arbres phylogénétiques…).
Description
La bio-informatique a pour but d'intégrer des données d'origines très diverses pour modéliser les systèmes vivants afin de comprendre et prédire leurs comportements (analyse du génome, modélisation de l'évolution d'une population animale, modélisation moléculaire, reconstruction d'arbres phylogénétiques…). Ce livre est axé sur la bio-informatique des protéines. Il aborde de manière simple les tâches courantes qu'un biologiste ou un biochimistedoit savoir traiter sans avoir recours au spécialiste. Cette nouvelle édition a été enrichie de nouvelles notions comme les réseaux de neurones, les machines à vecteurs de supports, l'apprentissage profond et les alphabets structuraux. Sommaire : La composition en acides aminés. Bases de données pour données de bases. La comparaison de deux séquences. Recherche dans les banques. Alignement de séquences. Bases théoriques de la phylogénie moléculaire. Algorithmes pour la phylogénie moléculaire. Recherche de fonctions. Profils physico-chimiques. Prédictions de structures secondaires. Structures 3D. Modélisation de structures 3D. Détection de sites 3D dans les protéines. Cas pratique d'analyse de séquences. Cas pratique de modélisation moléculaire de protéine par homologie.
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